Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FAM3AP98173 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms