Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PTPRMP28827 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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PTPRMP28827 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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PTPRMP28827 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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PTPRMP28827 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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