Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
POLD1P28340 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
POLD1P28340 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
POLD1P28340 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
POLD1P28340 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms