Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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