Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms