Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLKQ9UBT6 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms