Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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