Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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