Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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