Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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