Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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