Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PWP1Q13610 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms