Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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