Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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NPRL3Q12980 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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NPRL3Q12980 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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NPRL3Q12980 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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NPRL3Q12980 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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NPRL3Q12980 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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