Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms