Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PDGFDQ9GZP0 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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