Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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ZNF548Q8NEK5 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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