Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms