Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms