Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms