Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SS18Q15532 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SS18Q15532 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SS18Q15532 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms