Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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