Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms