Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms