Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms