Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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