Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CUL4AQ13619 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CUL4AQ13619 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CUL4AQ13619 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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