Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms