Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms