Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CENPFP49454 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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