Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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