Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CLDN9O95484 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CLDN9O95484 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CLDN9O95484 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CLDN9O95484 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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CLDN9O95484 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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CLDN9O95484 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN9O95484 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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