Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms