Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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TM6SF1Q9BZW5 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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TM6SF1Q9BZW5 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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TM6SF1Q9BZW5 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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TM6SF1Q9BZW5 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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TM6SF1Q9BZW5 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TM6SF1Q9BZW5 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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TM6SF1Q9BZW5 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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