Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 FBN2-204ENST00000508053 11132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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