Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.6 ms