Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DUSP4Q13115 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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