Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CTNND2-205ENST00000503622 2982 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC011369.1-201ENST00000517408 2181 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC244102.1-201ENST00000437309 848 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC068044.1-201ENST00000441585 1978 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 UGT2B4-206ENST00000512583 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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MKRN3Q13064 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 STAT4-201ENST00000358470 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TRIM5-201ENST00000380027 2290 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
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