Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NPRL3Q12980 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms