Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 PPFIA2-216ENST00000549396 5363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CENPFP49454 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CENPFP49454 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms