Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC004893.2-201ENST00000360902 3398 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MEFV-202ENST00000339854 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC069281.1-201ENST00000392471 570 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 C1QTNF9-AS1-201ENST00000449656 470 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 FAM197Y9-203ENST00000505707 345 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC003098.1-201ENST00000591540 494 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 FAM197Y4-201ENST00000616275 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 FAM197Y5-203ENST00000619815 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AMPD2-202ENST00000342115 3728 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 IFT122-203ENST00000348417 3877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PLEKHA3-201ENST00000234453 13880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZSCAN22-201ENST00000329665 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 HAL-201ENST00000261208 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 BEST1-201ENST00000378043 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC020978.10-201ENST00000623181 2704 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 NXF5-207ENST00000537026 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 NFYA-201ENST00000341376 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ARHGEF9-233ENST00000637520 5682 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL008729.1-203ENST00000606150 2305 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ARHGAP32-206ENST00000527272 5289 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC016909.2-201ENST00000424510 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GLRA1-202ENST00000455880 1707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF154-202ENST00000512439 5687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 STXBP5L-208ENST00000497029 3036 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNU1-7P-201ENST00000364105 164 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC007036.1-201ENST00000430537 674 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL109659.1-201ENST00000431986 651 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PFN1P9-201ENST00000475753 433 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNF215-208ENST00000619645 555 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LAMTOR5-AS1-236ENST00000626261 464 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 EXOC6-202ENST00000371543 2714 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NDUFB5-214ENST00000493866 4046 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC02075-201ENST00000509950 1754 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DCTN4-215ENST00000627368 1774 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FAM53C-201ENST00000239906 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 WWC1-209ENST00000521089 3562 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL033381.1-201ENST00000314040 3435 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PDHA2-201ENST00000295266 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 Z93929.2-201ENST00000615011 2623 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ENPEP-201ENST00000265162 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LAMA4-205ENST00000389463 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NTRK2-204ENST00000359847 6646 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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