Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TSPOP30536 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TSPOP30536 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms