Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 378.3 ms