Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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