Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BHLHE41Q9C0J9 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms