Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms