Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
COL24A1Q17RW2 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms