Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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