Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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TCOF1Q13428 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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