Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 MAPK10-333ENST00000641607 2481 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 LRRC4C-204ENST00000530763 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 HAUS2-201ENST00000260372 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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